镇巴县地处大巴山西部，米仓山东段。巴山主脊东西横亘，构成南北两个地理单元，成为嘉陵江、汉江两大水系的分水岭。地质构成以褶皱、断层为主，喀斯特地貌发育，多溶洞、暗河，地表岩石多为沉积岩和变质岩。境内沟谷幽深，山势陡山峭，相对高差大。最高点—巴山主峰箭杆山海拔2534米，最低点—巴庙镇烂柴沟沟口海拔416米，垂直高差2118米。地形以中山地貌为主，海拔800米以下低山面积占8.4%，平均高度为1231.4米。地势西北高，东南低，南坡缓，北坡陡。25度以上坡度面积占84.4%。不同高度、坡度组合，构成境内多样的地形地貌。本县属北亚热带，东南季风湿润区，大陆性较强，气温年差较大。平均气温13.8℃。土地资源：2000年底全县耕地面积为68.02万亩，人均耕地面积2.52亩，土地资源呈现四大特点：垂直分布差异大，从矮山到高山，地跨北亚热带、暖温事和中温带；地形复杂，土地类型多样，山、川、谷、坝、沟、河、平、梁皆有；陡坡多，缓坡少，土层瘠薄，水蚀严重；林草面积大。

     林特资源：林地面积371.6万亩，其中有林地225.86万亩，灌水林122.68万亩，疏林地17.76万亩，人工造林38.9万亩。森林覆盖率44.2%，活立木年生产量18万立方米。树种以栎类、竹类颁布最广，其次是松、柏、桦。野生竹以林竹主主，其中巴山木竹林49.6万亩，是亚洲同类竹种中最大的连片野生竹林。林特资源主要有漆、木耳、香菇、核桃、茶叶、桑、桐、棕、果、药材和野生动植物。其中中药材资源达236种，被称为“天然药库”。
     矿产资源：截止2000年底，已发现各类矿产资源25种，探明或基本探明储量的12种，其中金属矿3种，化工原料矿3种，建材及其它非金属矿4种，燃料矿2种。已开采利用的有：煤炭、板石、铁矿、硫铁矿、锰矿、磷矿、钡矿、毒重石、重晶石、黄粘土、大理石、花岗石等14种。此外铅锌厂、铝土矿、钡矿、方解石、膨润土、硅石、钾矿、石英石、金属镁、矾矿等地下资源储量大、品位高。